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單細(xì)胞/微球包裹,液滴測(cè)序
簡(jiǎn)介
PreciGenome搭建的微流控單細(xì)胞研究平臺(tái),是用于將細(xì)胞/基因條形碼微球群分離為包裹有單細(xì)胞或單一條形碼微球的微液滴的實(shí)用先進(jìn)工具,可以提供從單細(xì)胞水平研究基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)學(xué)和代謝組學(xué),從而能系統(tǒng)研究大量細(xì)胞群體中的細(xì)胞異質(zhì)性。單細(xì)胞分析系統(tǒng)以一個(gè)嶄新的視角去探索疾病研究中組織和細(xì)胞群體的組成、動(dòng)力學(xué)和調(diào)節(jié)機(jī)制。
PreciGenome在基于液滴微流控技術(shù)的基礎(chǔ)上,搭建了一個(gè)自動(dòng)化單細(xì)胞研究平臺(tái),該平臺(tái)可將單個(gè)細(xì)胞和單一基因條形碼微球包裹在液滴中(單個(gè)水凝膠微球的微液滴包裹率可達(dá)90%,同時(shí)包裹單個(gè)細(xì)胞和單個(gè)微球的微液滴包裹率高達(dá)9%)。
平臺(tái)靈活開放
使用簡(jiǎn)單方便
流程自動(dòng)化
一次性微流控芯片
經(jīng)濟(jì)高效的單細(xì)胞研究解決方案
包裹細(xì)胞尺寸為1-15μm
4個(gè)獨(dú)立壓力輸出
壓力/流量準(zhǔn)確度低至0.25%(滿量程)
壓力穩(wěn)定性低至0.05%(滿量程)
集成高速成像系統(tǒng),即插即用
成像速率:1280*1024 @ 1050fps,幀率可達(dá)38000 fps(低分辨率)
放大倍率可調(diào),mm至μm視野均被覆蓋
液滴成像速曝光時(shí)間低至1μs,可觀察以兆赫茲頻率流動(dòng)的液滴、顆?;蚣?xì)胞
配有觸摸顯示屏,自帶HDMI高清輸出,外接顯示器方便可靠
系統(tǒng)配置表
產(chǎn)品編號(hào) | 描述 | 數(shù)量 |
PG-MFC-8CH | 微流控高精密壓力控制器 | 1臺(tái) |
PG-HSV-M | 高速成像系統(tǒng) | 1臺(tái) |
PG-RSV | 儲(chǔ)液連接頭 容積230μL,10個(gè)/包 | 1包 |
PG-LFS-2000(可選) | 液體流量傳感器 測(cè)量范圍為0-5mL/min | 3個(gè) |
PG-LUR-kit | 高精密壓力控制器微流體魯爾連接套件 10”長(zhǎng),外徑1/8”,1/16” 兩個(gè)魯爾連接頭 | 3套 |
PG-Sin-PDMS | 四通道液滴式包裹芯片 材質(zhì)為PDMS | 1片 |
此系統(tǒng)包含1個(gè)壓力/流量控制器(PG-MFC-8CH),1個(gè)用于觀察和記錄圖像、視頻的高速成像系統(tǒng)(集成光學(xué)部件,照明設(shè)備和一個(gè)微流控芯片載物臺(tái)),以及1個(gè)用于參數(shù)優(yōu)化和流程自動(dòng)化的軟件。系統(tǒng)實(shí)物連接見下圖,連接簡(jiǎn)單且高靈活度,可在自動(dòng)模式和手動(dòng)模式間自由切換。用戶在做單細(xì)胞研究時(shí),可選擇我們的標(biāo)準(zhǔn)微流控芯片(正在申請(qǐng)**),當(dāng)然用戶也可選擇自行設(shè)計(jì)的芯片。
系統(tǒng)連接示意圖:
案例一:水凝膠微球包裹:包裹率高達(dá)90%。
水凝膠微球通過(guò)表面修飾附著官能團(tuán)有著廣泛的應(yīng)用,如細(xì)胞培養(yǎng)和藥物給藥研究等。此應(yīng)用案例通過(guò)結(jié)合修飾上不同官能團(tuán)的單分散水凝膠微球技術(shù)和液滴微流控技術(shù),實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞和單微球在微液滴中的高包裹率,從而使得每個(gè)微液滴都成為了一個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)室,可幫助研究人員研究單個(gè)細(xì)胞在不同環(huán)境下的行為表現(xiàn)。若在水凝膠微球上添加基因條形碼,可進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞RNA測(cè)序,輔助研究人員研究罕見的癌細(xì)胞突變、新藥測(cè)試、CRISPR篩選等。此外,單細(xì)胞分離與分選也可在此平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)。
由PreciGenome提供的微流控芯片,其通道結(jié)構(gòu)經(jīng)過(guò)專門設(shè)計(jì),可實(shí)現(xiàn)單個(gè)水凝膠微球的液滴包裹。我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,此單細(xì)胞研究平臺(tái)可實(shí)現(xiàn)單個(gè)水凝膠微球在微液滴中的包裹率高達(dá)90%。
案例二:液滴測(cè)序,單個(gè)微球包裹率為10%,兩個(gè)微球在一個(gè)液滴中同時(shí)包裹率為1%。
此應(yīng)用中,我們使用兩種10μm聚苯乙烯微球(光學(xué)性能不同)來(lái)模擬液滴測(cè)序中細(xì)胞和條形碼微球的捕獲過(guò)程。如下圖所示,微球1和微球2分別模擬條形碼微球和細(xì)胞,從兩個(gè)進(jìn)樣孔進(jìn)入芯片。在第三個(gè)進(jìn)樣孔,采用液滴生成油作為連續(xù)相,以生成油包水型液滴。
使用此系統(tǒng),可以生成尺寸均一的穩(wěn)定液滴,且被包裹在液滴中的微球1和微球2服從泊松分布。為了盡量避免多個(gè)同類微球被包裹在同一液滴中,需將微球溶液稀釋,使*終生成的液滴中,包裹有單個(gè)微球的比例在10%左右。因此,生成的液滴中,約1%的液滴會(huì)同時(shí)包裹有單個(gè)微球1和微球2 ,如下圖所示。
上圖中,黑色圓狀為液滴,粉紅色小點(diǎn)為微球1,黃色小點(diǎn)為微球2,粉色矩形框內(nèi)的液滴同時(shí)包裹有單個(gè)微球1和微球2。
水凝膠微球包裹
液滴測(cè)序
單細(xì)胞封裝和PCR擴(kuò)增
單細(xì)胞抗體研究
單細(xì)胞分析
細(xì)胞構(gòu)建
RNA測(cè)序樣品準(zhǔn)備
生物制藥
耐藥性研究
雙乳液
酶進(jìn)化
合成生物學(xué)
診斷學(xué)
1. 這套系統(tǒng)制備的微球包裹率是多少?
答:水凝膠微球的包裹率高達(dá)90%;液滴測(cè)序中,單個(gè)微球包裹率為10%,兩個(gè)微球液同時(shí)包裹率為1%。
2. 貴司提供的是一整套的單細(xì)胞研究平臺(tái)嗎?
答:是的,我們提供完整的系統(tǒng)和解決方案,包含此平臺(tái)中所包含的高精密壓力控制器、流量傳感器、微流控芯片、高速成像系統(tǒng)、毛細(xì)管以及接頭等所有部件。
3. 此平臺(tái)支持定制嗎?
答:支持,如果用戶有自身特殊應(yīng)用要求,請(qǐng)和我們聯(lián)系,我們將根據(jù)用戶需求提供整套的系統(tǒng)性解決方案。
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