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全自動、高通量對大量植株進行成像 特別適合植物功能基因組學(xué)和植物表型組學(xué) 遺傳育種、突變株篩選、表型篩選的強大工具 機器人技術(shù)、圖像分析和大規(guī)模計算能力的**結(jié)合 實驗室高通量植物成像系統(tǒng)——Scanalyzer HTS是一套可以全自動、高通量對大量小植株進行成像的系統(tǒng),可以選擇配置可見光(VIS)成像、近紅外(NIR)成像、紅外(IR)成像、熒光成像或激光掃描3D成像(只適合高度15 cm以下的小植株)中的一種或多種。成像系統(tǒng)帶程控移動裝置,可以在X軸和Y軸上進行移動,并配有射頻或條形碼讀取器。Scanalyzer HTS系統(tǒng)通過軟件控制攝像頭移動到樣品上方(多孔板或小盆)進行拍照,照片數(shù)據(jù)與該樣品的電子標記(射頻或條形碼)一起存儲。軟件也可控制攝像頭對多孔板上的每個孔進行單獨成像,每個孔的數(shù)據(jù)分布存儲(告訴軟件多孔板類型,然后自動編碼,如A01、A02……)。(下載演示視頻) 軟件可以控制系統(tǒng)每天自動對樣品進行成像,獲得樣品成像的時間動力學(xué)變化。只要點擊樣品的編碼,就可以獲得樣品的圖像及分析數(shù)據(jù)的時間動力學(xué)變化,并可進行復(fù)雜的統(tǒng)計學(xué)分析和圖表分析。 系統(tǒng)提供頂部光源和底部光源,并可通過軟件控制光強變化。根據(jù)測量樣品數(shù)目的多少,可以選擇配置4、24、48或72個多孔板的版本,不同版本的外觀尺寸差別很大。如有特殊需要,可以定制更大版本。 由于全自動、高通量測量獲得的數(shù)據(jù)非常龐大,本系統(tǒng)必須配置服務(wù)器來存儲數(shù)據(jù)。選購PHP遠程數(shù)據(jù)庫軟件,還可以對系統(tǒng)進行遠程原理、控制和分析。 主要功能 ◆ 全自動、高通量對植物等小型樣品進行可見光成像、近紅外成像、紅外成像、熒光成像(包括整株GFP成像)和/或激光掃描3D成像(每套系統(tǒng)可選擇一種或多種) ◆ 通過可見光成像可以測量植物的結(jié)構(gòu)、寬度、密度、對稱性、葉長、葉寬、葉面積、葉角度、葉顏色、葉病斑、種子顏色、種子顏色面積等等50多個參數(shù) ◆ 通過近紅外成像可以分析植物的水分分布狀態(tài)、水力學(xué)研究、脅迫生理學(xué)研究等 ◆ 通過紅外成像可以進行植物干旱脅迫研究、蒸騰研究等 ◆ 通過熒光成像可以分析植物的生理狀態(tài) ◆ 樣品可以是培養(yǎng)在多孔板中(如12、24、48、96、384孔板),也可以是長在小花盆中。 ◆ 高通量測量大量樣品,標準配置可選擇裝4、24、48或72個多孔板的版本 ◆ 花盆大小范圍,直徑3.64 ~ 20.51 cm,高2.79 ~ 15.44 cm ◆ 可選擇成像分辨率,特別適用于96孔板高精度測量 ◆ 進行動物/昆蟲的游動/運動測試時,可自動獲取圖像 應(yīng)用領(lǐng)域 植物功能基因組學(xué)、植物表型組學(xué)、遺傳育種、突變株篩選、植物生理學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)、植物病理學(xué)、植物形態(tài)建模、植物生物信息學(xué)、種子生理學(xué)、種子病理學(xué)、植物脅迫生理學(xué)、植物水力學(xué)等研究領(lǐng)域。 HTS系統(tǒng)的成像掃描模式
應(yīng)用實例 ◆ 整盆擬南芥的GFP成像 實驗室型高通量植物成像系統(tǒng)Scanalyzer HTS特別適合于擬南芥植株的整株甚至是整盆的GFP成像。軟件可以自動過濾掉盆和土壤引起的噪音,把有用的圖像抽提出來進行進一步分析。對于不同的GFP,可以定制激發(fā)波長。下圖是整盆擬南芥的eGFP成像。 ◆ 通過熒光成像進一步分析植物的生理狀態(tài)植物的可見光成像更多的是反映植物的表觀信息,對生理狀態(tài)的反映有限。而熒光成像可以較深入的反映到植物的生理狀態(tài),如下圖中,熱水處理部分葉片后,可見光成像看不出有什么區(qū)別,而熒光成像則可以反映出受損傷的部位。
◆ 植物的生長動力學(xué)變化高通量Scanalyzer HTS系統(tǒng)特別適合于研究植物的形態(tài)學(xué)指標和在生長過程中這些指標隨時間的動力學(xué)變化,如下圖就是利用Scanalyzer HTS系統(tǒng)研究的擬南芥植株面積隨時間的動力學(xué)變化。利用Scanalyzer 3D系統(tǒng)可以研究玉米等大植株整個生活史的動力學(xué)曲線,各種形態(tài)學(xué)指標都可以測量。
◆ 利用表型參數(shù)的雷達圖進行植株分類 通過Scanalyzer HTS系統(tǒng)可以獲得大量的植物表型參數(shù),利用這些表型參數(shù)繪制的雷達圖,可作為反映植株形態(tài)的“指紋圖譜”。根據(jù)這種“指紋圖譜”可以對植株根據(jù)表型進行分類,特別適合于數(shù)量性狀基因座(QTL)研究。下面兩個圖根據(jù)擬南芥的表型雷達圖進行的植物分類,對于其它大型的農(nóng)作物用Scanalyzer 3D系統(tǒng)測量后,也可以獲得類似的結(jié)果。
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