貝克曼庫爾特商貿(mào)(中國)有限公司
已認證
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在過去十多年里,隨著二代測序技術(shù)的發(fā)展,測序成本已經(jīng)下降了幾個數(shù)量級,但是二代測序樣品文庫制備成本仍然高昂,過程依舊復(fù)雜。微生物及病毒全基因組測序能幫助科學家們確認基因組編輯正確性,解析病原的變異及進化,是高通量基因編輯和調(diào)查微生物組、病毒學研究的常規(guī)工作。液體處理專家貝克曼庫爾特創(chuàng)新推出Biomek i5+Echo 525超高通量自動化整合系統(tǒng),幫助您實現(xiàn)二代測序文庫構(gòu)建中的高通量和低成本的需求。
圖1. Biomek i5 +Echo 525整合系統(tǒng)。通過將Echo 525快速、精確的聲波移液技術(shù)與Biomek i系列工作站強大而靈活的功能相結(jié)合,可以將文庫制備工作提高到超高通量。
我們使用illumina Nextera XT DNA試劑盒,以3種不同的微生物樣品類型(蠟狀芽孢桿菌,大腸埃希氏菌,紅球菌)進行實驗,測試了該微量化方法的有效性。Biomek i5+Echo 525 整合系統(tǒng)的微量化文庫制備方案可將反應(yīng)體系縮小20倍,降低每次反應(yīng)的試劑成本;可單次處理384個樣品,提高樣品處理通量。 值得注意的是,根據(jù)Illumina的標準推薦實驗流程,手工操作8個樣品的時間約為3小時。利用Biomek i5 +Echo 525整合系統(tǒng),完成384個樣品的文庫制備僅需4小時,該時間包括了試劑分裝和孵育。試劑分裝利用選擇性吸頭移液功能,可處理靈活多變的樣品數(shù)量。微量化文庫制備使更高的通量成為可能,而無需大幅增加時間。
圖2. 微量化Illumina Nextera XT文庫制備的自動化流程。灰色代表Biomek i5完成步驟,藍色代表Echo 525完成步驟,紅色代表手工干預(yù)步驟。Echo用于反應(yīng)體系構(gòu)建及Normalization/pooling;Biomek配置384通道加樣器,并具有選擇性吸頭移液功能,用于分裝Echo所需試劑并進行產(chǎn)物純化;可選配臺面整合的PCR儀,用于PCR擴增和孵育,減少人為干預(yù)。
圖3.向?qū)降能浖僮鹘缑妫ㄗ螅团_面自動校對功能 (右)。如左圖所示,在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量,是否使用臺面整合的PCR儀,以及運行工作流程的哪個部分。具備臺面自動校對功能(右圖),當操作人員完成耗材擺放后,工作站可自動判定耗材擺放是否正確,對錯誤擺放位置進行提示,確保程序運行前臺面擺放正確。避免由于人為擺放耗材錯誤,導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑、時間損失。
Better together—— Echo + Biomek自動化NGS建庫方案:
文庫構(gòu)建體系縮小20倍相應(yīng)降低了試劑成本,無需吸頭的納升級聲波介導(dǎo)移液節(jié)省了耗材成本。
單次384個樣品的處理,在單位時間內(nèi)實現(xiàn)了超高通量的樣本處理。
精準的納升級至微升級移液技術(shù)及自動化處理,是獲得真實結(jié)果的保障。
向?qū)杰浖僮鹘缑婧团_面自動校對功能可減少人為操作失誤。
強大的數(shù)據(jù)追蹤系統(tǒng)能實現(xiàn)樣本溯源及追蹤,保證數(shù)據(jù)對接準確性。
還等什么,快來向我們索取相關(guān)資料,更新你的實驗裝備吧!
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