貝克曼庫爾特商貿(mào)(中國)有限公司
已認證
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目標區(qū)域捕獲測序技術(shù),是根據(jù)已知特定基因組區(qū)域序列設(shè)計寡核苷酸探針,通過雜交將目標區(qū)域捕獲富集進行二代測序。其針對目標區(qū)域深度測序,增加了檢查靈敏度和準確性。既滿足研究需求,又降低測序成本,在科研、臨床中均備受關(guān)注。
液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動化捕獲測序方案,幫助您實現(xiàn)自動化、標準化的捕獲測序。 由自動化工作站進行基因捕獲,可以減少手工操作時間,提高工作效率,增加結(jié)果的重復(fù)性和均一性。 Biomek工作站可實現(xiàn)從核酸提取,文庫構(gòu)建,定量混樣到捕獲的整體實驗流程。
Figure 1. 捕獲測序文庫構(gòu)建自動化流程
由Biomek成功自動化的雜交捕獲試劑盒:
- Agilent HaloPlex? Target Enrichment - Ion Torrent
- Agilent SureSelect XT?
- Epicentre ScriptSeq? Complete Gold Low Input
- Illumina Nextera? Rapid Capture
- Illumina TruSeq? Exome
- Illumina TruSeq? Rapid Exome
- Illumina TruSight? Cancer
- Illumina TruSight? Tumor 15
- Illumina TruSight? Tumor 170
- IDT xGen? Exome Research Panel
- NEB NEBNext Direct? Cancer HotSpot Panel
- Roche Nimblegen SeqCap EZ? for Illumina NGS
Biomek自動化捕獲測序數(shù)據(jù)展示
Figure 2. IDT xGen? Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備。
上圖: 片段分析,其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標片段峰;
下圖:Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結(jié)果。
Figure 3. IDT xGen?雜交捕獲試劑盒歷史手工數(shù)據(jù)vs.
Biomek i7自動化工作站完成數(shù)據(jù)。A. 平均中靶率,B. 重復(fù)率,C. 覆蓋度,D. GC偏移。
Biomek向?qū)杰浖僮鹘缑?/span>
在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量,是否使用臺面整合的PCR儀,以及運行工作流程的哪個部分。此外,具備臺面自動校對功能,當操作人員完成耗材擺放后,工作站可根據(jù)攝像頭拍攝,自動判定耗材擺放是否正確,對錯誤擺放位置進行提示。避免由于人為擺放耗材錯誤,導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑、時間損失。
Figure 4. 向?qū)杰浖僮?,IDT xGen? 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。
Biomek自動化捕獲測序——實踐速度與通量的飛躍
Figure 5. 完成 24/48/96個樣本的自動化IDT xGen?雜交捕獲測序文庫制備預(yù)估耗時。
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